Identification of genetic variants of <i><scp>LGI</scp>1</i> and <i><scp>RTN</scp>4R</i> (NgR1) linked to schizophrenia that are defective in NgR1–<scp>LGI</scp>1 signaling
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The protein NgR1 is encoded by RTN4R, a gene linked to schizophrenia. We previously reported NgR1 as receptor for the epilepsy-linked protein LGI1. NgR1 regulates synapse number and synaptic plasticity, whereas LGI1 antagonizes NgR1 signaling and promotes synapse formation. Impairments in synapse formation are common in neurological disease and we hypothesized that an LGI1-NgR1 signaling pathway may contribute to the development of schizophrenia. METHODS: We screened two unrelated schizophrenic populations for variants in RTN4R and LGI1 using whole exome sequencing and Sanger sequencing. We tested the ability of LGI1 to bind rare coding variants of NgR1 using a cell surface binding assays and the signaling ability of NgR1 using COS7 cell-spreading assays. RESULTS: We observed a previously reported rare coding variant in RTN4R (c.1195C>T, pR399W). We report the first LGI1 mutations to be identified in individuals with schizophrenia. Three different LGI1 mutations were found, two missense mutations (c.205G>A, p.V69I) and (c.313G>A, V105M), and an intronic variant (g.897T>C) that likely leads to a protein truncation. We found NgR1(R119W) and NgR1(277C) have a reduced ability to bind LGI1 in a cell surface binding assay. COS7 cell-spreading assays reveal that NgR1 mutants are impaired in their ability to mediate RhoA activation. CONCLUSION: Variants in NgR1 and LGI1 may be associated with schizophrenia and variants in NgR1 found in schizophrenic patients have impaired LGI1-NgR1 signaling. Impaired LGI1-NgR1 signaling may contribute to disease progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».