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Enregistrement W2300364756 · doi:10.1002/mgg3.215

Identification of genetic variants of <i><scp>LGI</scp>1</i> and <i><scp>RTN</scp>4R</i> (NgR1) linked to schizophrenia that are defective in NgR1–<scp>LGI</scp>1 signaling

2016· article· en· W2300364756 sur OpenAlexafffund
Rhalena A. Thomas, Amirthagowri Ambalavanan, Guy A. Rouleau, Philip A. Barker

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune Neurological Disorders and Treatments
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologySynapseMissense mutationSynaptic plasticityMutationGeneticsGeneNeuroscienceReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The protein NgR1 is encoded by RTN4R, a gene linked to schizophrenia. We previously reported NgR1 as receptor for the epilepsy-linked protein LGI1. NgR1 regulates synapse number and synaptic plasticity, whereas LGI1 antagonizes NgR1 signaling and promotes synapse formation. Impairments in synapse formation are common in neurological disease and we hypothesized that an LGI1-NgR1 signaling pathway may contribute to the development of schizophrenia. METHODS: We screened two unrelated schizophrenic populations for variants in RTN4R and LGI1 using whole exome sequencing and Sanger sequencing. We tested the ability of LGI1 to bind rare coding variants of NgR1 using a cell surface binding assays and the signaling ability of NgR1 using COS7 cell-spreading assays. RESULTS: We observed a previously reported rare coding variant in RTN4R (c.1195C>T, pR399W). We report the first LGI1 mutations to be identified in individuals with schizophrenia. Three different LGI1 mutations were found, two missense mutations (c.205G>A, p.V69I) and (c.313G>A, V105M), and an intronic variant (g.897T>C) that likely leads to a protein truncation. We found NgR1(R119W) and NgR1(277C) have a reduced ability to bind LGI1 in a cell surface binding assay. COS7 cell-spreading assays reveal that NgR1 mutants are impaired in their ability to mediate RhoA activation. CONCLUSION: Variants in NgR1 and LGI1 may be associated with schizophrenia and variants in NgR1 found in schizophrenic patients have impaired LGI1-NgR1 signaling. Impaired LGI1-NgR1 signaling may contribute to disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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