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Enregistrement W2301953100 · doi:10.1093/infdis/jiw088

Responder Interferon λ Genotypes Are Associated With Higher Risk of Liver Fibrosis in HIV–Hepatitis C Virus Coinfection

2016· article· en· W2301953100 sur OpenAlexafffundabout
Nasheed Moqueet, Curtis Cooper, M. John Gill, Mark Hull, Robert W. Platt, Marina B. Klein

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreAIDS VancouverOttawa HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGilead SciencesViiV HealthcareMcMaster UniversityStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésCoinfectionVirologyHepatitis C virusInterferonMedicineGenotypeHepacivirusHuman immunodeficiency virus (HIV)Hepatitis CFibrosisImmunologyVirusHepatitis B virusBiologyInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Liver fibrosis progresses faster in individuals coinfected with human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis C virus (HCV). Interferon λ3 (IFN-λ3) has both antiviral and proinflammatory properties. Genotypes at IFNL single-nucleotide proteins (SNPs; rs12979860CC and rs8099917TT) are linked to higher HCV clearance, potentially via rs8103142. We examined the relationship between IFN-λ genotypes and significant liver fibrosis in HIV-HCV coinfection. METHODS: From the prospective Canadian Co-infection Cohort (n = 1423), HCV RNA-positive participants in whom IFN-λ genotypes were detected and who were free of fibrosis, end-stage liver disease, and chronic hepatitis B at baseline (n = 485) were included. Time to significant fibrosis (defined as an aspartate transaminase level to platelet count ratio index [APRI] of ≥1.5) by IFN-λ genotypes was analyzed using Cox proportional hazards, with adjustment for age, sex, ethnicity, alcohol use, CD4(+) T-cell count, HCV genotype, γ-glutamyl transferase level, and baseline APRI. Haplotype analysis was performed, with adjustment for ethnicity. RESULTS: A total of 125 participants developed fibrosis over 1595 person-years (7.84 cases/100 person-years; 95% confidence interval [CI], 6.58-9.34 cases/100 person-years). Each genotype was associated with an increased fibrosis risk, with adjusted hazard ratios of 1.37 (95% CI, .94-2.02) for rs12979860CC, 1.34 (95% CI, .91-1.97) for rs8103142TT, and 1.79 (95% CI, 1.24-2.57) for rs8099917TT. Haplotype TCT was also linked with a higher risk (hazard ratio, 1.14 [95% CI, .73-1.77]). CONCLUSIONS: IFN-λ SNPs rs12979860, rs8099917, and rs81013142 were individually linked to higher rates of fibrosis in individuals with HIV-HCV coinfection. IFN-λ genotypes may be useful to target HCV treatments to people who are at higher risk of liver disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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