Claudin 1 Expression Levels Affect miRNA Dynamics in Human Basal-Like Breast Cancer Cells
Notice bibliographique
Résumé
Deemed a putative tumor suppressor in breast cancer, the tight junction protein claudin 1 has now been shown to be highly expressed in the basal-like molecular subtype. Moreover, recent in vitro studies show that claudin 1 can regulate breast cancer cell motility and proliferation. Herein, we investigated whether microRNA (miRNA) dysregulation is associated with alterations in the level of claudin 1. Using next-generation sequencing (NGS), we identified seven miRNAs (miR-9-5p, miR-9-3p, let-7c, miR-127-3p, miR-99a-5p, miR-129-5p, and miR-146a-5p) that were deregulated as a consequence of claudin 1 overexpression in the MDA-MB231 human breast cancer (HBC) cell line. Most of these miRNAs have been associated with tumor suppression in a variety of cancers, including breast cancer. Moreover, through gene expression profiling analysis, we identified epithelial-mesenchymal transition-related genes, including platelet-derived growth factor receptor-beta (PDGFRB) and cadherin 1 (CDH1, E cadherin), whose downregulation correlated with claudin 1 overexpression. Collectively, we show for the first time that in HBC, claudin 1 can alter the dynamics of a number of miRNAs involved in tumor progression. Our data suggest that the dysregulated expression of these miRNAs, in conjunction with the high claudin 1 levels, could serve as a useful biomarker that identifies a subset of tumors within the poorly characterized basal-like subtype of breast cancer. Further studies are warranted to determine the role of these miRNAs in facilitating the function of claudin 1 in breast cancer.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».