Integrating ecological genomics and eco-evo-devo reveals multiple adaptive peaks in ant populations of the Arizona Sky Islands
Notice bibliographique
Résumé
Uncovering the genetic basis of adaptation is a great challenge facing evolutionary biologists. We ask where is the locus of adaptation from the perspective of ecological genomics (ecogen) and evolutionary developmental biology (evodevo). Ecogen focuses on identifying loci under selection between populations in different environments by scanning genome-wide patterns of genetic divergence, while evodevo focuses on candidate developmental regulatory genes and networks underlying phenotypic differences between species and higher taxa. We attempt to reconcile these different perspectives by studying the response of ant populations to past climate change on the Arizona Sky Islands - high elevation mountain ranges that represent a replicated natural experiment. We previously used an evodevo approach to show that adaptation to climatic changes in the Arizona Sky Islands in the ant species Monomorium emersoni occurred through repeated changes within the gene network underlying the development of alternative dispersal phenotypes: winged and wingless queens. Here, using an ecogen approach we uncovered several loci under positive selection that associate with habitat temperature. These temperatureassociated loci show a repeated increase in frequency following climatic changes on each of the Sky Islands. Surprisingly, gene flow between locations within a Sky Island is restricted by temperature adaptation along the ecological gradient and not by dispersal phenotype. This finding suggests that determination of winged and wingless queens may be developmentally plastic, and this plasticity may facilitate jumps between adaptive peaks on a fitness landscape. Integration of evodevo and ecogen reveals multiple adaptive peaks and predictability at multiple biological levels within a single species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».