TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF MOUSE SPLEEN IN RESPONSE TO EGG OVOMUCOID TREATMENT (141.11)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Food allergy is a serious health concern among infants and young children. Despite its growing prevalence, our current understanding of the molecular mechanism(s) of food allergy remains incomplete. In this study, transcriptome profile of spleen from BALB/c mice was analyzed using Affymetrix arrays. Female BALB/c mice 6-8 weeks of age were orally exposed twice weekly for 5 wks with 1 mg of egg ovomucoid (OVM) and 10 µg of cholera toxin (CT). Control mice were similarly sensitized with 100 µl of 10 µg/µl amino acid solution and CT. At wk 6, experimental and control mice were challenged by intraperitoneal (i.p.) injection with 1 mg of OVM and amino acid solution respectively. Mice were euthanized 40 min post challenge to collect the spleens. Total RNA extracted from spleen was subjected to microarray hybridization. Analysis of microarray data revealed 87 genes differentially expressed with at least ±1.5 fold (p≤0.05). Gene ontology (GO) analysis revealed several biological processes related to hypersensitivity, inflammation or immune response. Biological network analysis illustrated connections among some differentially expressed genes and several immune or hypersensitivity related processes. Expression of five differentially expressed genes from microarray experiment was validated by real-time RT-PCR. Results from this study revealed a network of genes that may enable us to better understand the underlying molecular mechanism(s) of food allergy.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».