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Enregistrement W2303776627 · doi:10.1101/043935

Nol12 is a multifunctional endonuclease at the nexus of RNA and DNA metabolism

2016· preprint· en· W2303776627 sur OpenAlexafffund
Daniel D. Scott, Carol Trahan, Pierre Zindy, Lisbeth C. Aguilar, Marc Y. Delubac, Karen E. Wei, Marlene Oeffinger

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRNABiologyCell biologyRibosome biogenesisDNAHelicaseRNA Helicase ADegradosomeDNA damageExosome complexTranscription (linguistics)Non-coding RNARibosomeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Endo‐ and exonucleases are major contributors to RNA metabolism through their diverse roles in maturation and turnover of different species of RNA as well as transcription. Recent data suggests RNA nucleases also affect genome stability programs and act along DNA repair pathways. Here, we describe Nol12 as a multifunctional RNA/DNA endonuclease found in different subcellular compartments - the nucleoplasm, where it co-localizes with the RNA/DNA helicase Dhx9 and paraspeckles, nucleoli as well as GW/P-bodies. We show that Nol12 is required for a key step in ribosomal RNA processing, separating large and small subunit precursors at site 2, rerouting ribosome biogenesis via an alternative pathway in its absence to ensure ribosome production. Furthermore, loss of Nol12 results in increased oxidized DNA levels followed by a rapid p53-independent ATR-Chk1-mediated apoptotic response, suggesting a role for Nol12 in the prevention or resolution of oxidative DNA damage. Identification of a complex Nol12 interactome, which includes NONO, Dhx9 and DNA-PK, further supports its diverse functions in RNA metabolism and DNA maintenance, establishing Nol12 as a multifunctional endonuclease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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