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Enregistrement W2304453014 · doi:10.14288/1.0099640

Conservation genetics of whitebark pine (Pinus albicaulis Engelm) in British Columbia

2009· article· en· W2304453014 sur OpenAlexaboutno aff
Jodie Krakowski

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPinus <genus>EngineeringForestryBiologyGeographyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pinus albicaulis Engelm. is a keystone subalpine species found throughout mountainous regions of western North America. Population genetic investigations in British Columbia using isozymes (17 populations, 12 loci) extracted from bud tissue revealed that the species has high levels of observed and expected heterozygosity compared to other pine species (0.213 and 0.262, respectively). Isozyme analysis (two populations, ten loci) using maternal gametopyte tissue and embryos extracted from seed elucidated that biparental inbreeding, and possibly selfing, is common (mean multilocus outcrossing rate = 0.73, mean single-locus outcrossing rate = 0.69). There is moderate population substructuring (FST = 0.061), typified by the clumped distribution of trees, influencing gene flow, although seed distribution by Clark's nutcracker appears to be the overriding factor influencing genetic patterns. There were few rare alleles found and genetic distances between populations were small (Nei's 1978 distance ranged from 0.006 to 0.134 and Cavalli-Sforza and Edwards' (1967) chord distance from 0.086 to 0.297). Genetic distances were weakly related to physical distances between populations (Mantel test, p = 0.036). Observed heterozygosity was significantly negatively correlated with longitude (R² = 0.295) and latitude (R² = 0.357). Population genetic parameters were consistent with other studies suggesting northerly postglacial recolonization from refugia in the Washington and Oregon Cascades and several more northern refugia in the Rockies, including the possiblity of a refugium near Roger's Pass, BC. Nearly all populations were observed to have Cronartium ribicola Fisch. (white pine blister rust) infections, mortality of trees of all ages was often present (due to various causes), and regeneration was often sparse or absent. A conservation strategy was developed based on the results of these investigations, concurrent with the priorities and recommendations of other agencies involved with whitebark pine conservation. Priorities included continuing surveys of natural stands in order to identify and monitor putatively resistant trees, collecting seed from all available seed sources and especially these selected individuals, establishing common garden tests to assess adaptive variation and screen for disease resistance, establishing field trials in natural habitats with a variety of hazard ratings for blister rust, developing appropriate seed and scion transfer guidelines, and maintaining a cooperative exchange in terms of materials and research with other jurisdictions involved in whitebark pine conservation. Future research may involve isolation of any specific resistance mechanisms, genetic transformation or cross-breeding of susceptible individuals, and bulk propagation of resistant individuals or families via rooting cuttings or somatic embryogenesis. In the longer term, breeding strategies involving controlled crosses of putatively restitant parents in order to produce hardy and disease resistant planting stock for a variety of hazard-rated sites should be instituted. Due to the extremely long generation time of this species, it is critical that conservation measures begin immediately.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,198

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,158
Écart entre enseignants0,153 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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