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Enregistrement W2305318049 · doi:10.1186/s12974-016-0531-9

Complex molecular and functional outcomes of single versus sequential cytokine stimulation of rat microglia

2016· article· en· W2305318049 sur OpenAlexafffund
Tamjeed Siddiqui, Starlee Lively, Lyanne C. Schlichter

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroinflammation · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensKrembil FoundationUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésMicrogliaNeuroscienceCytokineStimulationNeurologyMedicineNeuroinflammationPsychologyImmunologyInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Microglia are the "professional" phagocytes of the CNS. Phagocytosis is crucial for normal CNS development and maintenance, but it can be either beneficial or detrimental after injury or disease. For instance, white matter damage releases myelin debris that must be cleared by microglia in order for re-myelination to occur. However, phagocytosis can also produce damaging reactive oxygen species (ROS). Furthermore, microglia can acquire pro-inflammatory (M1) or anti-inflammatory (M2) activation states that affect cell functions. Although microglia are exposed to a changing cytokine environment after injury or disease, little is known about the molecular and functional consequences. Therefore, we applied several microglial activation paradigms, with or without myelin debris. We assessed (i) gene expression changes reflecting microglial activation and inflammatory states, and receptors and enzymes related to phagocytosis and ROS production, (ii) myelin phagocytosis and production of ROS, and (iii) expression and contributions of several ion channels that are considered potential targets for regulating microglial behavior. METHODS: Primary rat microglia were exposed to cytokines, individually or sequentially. First, responses to individual M1 or M2 stimuli were compared: IFN-γ plus TNF-α ("I + T"; M1 activation), interleukin-4 (M2a/alternative activation), and interleukin-10 (M2c/acquired deactivation). Second, sequential cytokine addition was used to assess microglia repolarization and cell functions. The paradigms were M2a→M1, M2c→M1, M1→M2a, and M1→M2c. RESULTS: M1 stimulation increased pro-inflammatory genes, phagocytosis, and ROS, as well as expression of Kv1.3, KCa3.1, and Kir2.1 channels. M2a stimulation increased anti-inflammatory genes, ROS production, and Kv1.3 and KCa3.1 expression. Myelin phagocytosis enhanced the M1 profile and dampened the M2a profile, and both phagocytosis and ROS production were dependent on NOX enzymes and Kir2.1 and CRAC channels. Importantly, microglia showed some capacity for re-polarization between M1 and M2a states, based on gene expression changes, myelin phagocytosis, and ROS production. CONCLUSIONS: In response to polarizing and re-polarizing cytokine treatments, microglia display complex changes in gene transcription profiles, phagocytic capacity, NOX-mediated ROS production, and in ion channels involved in microglial activation. Because these changes might affect microglia-mediated CNS inflammation, they should be considered in future experimental, pre-clinical studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,467

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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