Pathobiological Characterization of a Novel Reassortant Highly Pathogenic H5N1 Virus Isolated in British Columbia, Canada, 2015
Notice bibliographique
Résumé
In the current study, we describe the pathobiologic characteristics of a novel reassortant virus - A/chicken/BC/FAV-002/2015 (H5N1) belonging to clade 2.3.4.4 that was isolated from backyard chickens in British Columbia, Canada. Sequence analyses demonstrate PB1, PA, NA and NS gene segments were of North American lineage while PB2, HA, NP and M were derived from a Eurasian lineage H5N8 virus. This novel virus had a 19 amino acid deletion in the neuraminidase stalk. We evaluated the pathogenic potential of this isolate in various animal models. The virus was highly pathogenic to mice with a LD50 of 10 plaque forming units (PFU), but had limited tissue tropism. It caused only subclinical infection in pigs which did result in seroconversion. This virus was highly pathogenic to chickens, turkeys, juvenile Muscovy ducks (Cairnia moschata foma domestica) and adult Chinese geese (Anser cynoides domesticus) causing a systemic infection in all species. The virus was also efficiently transmitted and resulted in mortality in naïve contact ducks, geese and chickens. Our findings indicate that this novel H5N1 virus has a wide host range and enhanced surveillance of migratory waterfowl may be necessary in order to determine its potential to establish itself in the wild bird reservoir.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».