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Enregistrement W2306466871 · doi:10.1136/gutjnl-2015-310393

Development and validation of a histological index for UC

2015· article· en· W2306466871 sur OpenAlexaff
Mahmoud Mosli, Brian G. Feagan, Guangyong Zou, William J. Sandborn, Geert D’Haens, Reena Khanna, Lisa M. Shackelton, Christopher W. Walker, Sigrid Nelson, Margaret K. Vandervoort, Valerie Frisbie, Mark Samaan, Vipul Jairath, David K. Driman, Karel Geboes, Mark A. Valasek, Rish K. Pai, Gregory Y. Lauwers, Robert H. Riddell, Larry Stitt, Barrett G. Levesque

Notice bibliographique

RevueGut · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalWestern UniversityRobarts Clinical Trials
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésIntraclass correlationMedicineInternal medicineCorrelationGastroenterologyRating scaleNuclear medicinePsychometricsStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Although the Geboes score (GS) and modified Riley score (MRS) are commonly used to evaluate histological disease activity in UC, their operating properties are unknown. Accordingly, we developed an alternative instrument. DESIGN: Four pathologists scored 48 UC colon biopsies using the GS, MRS and a visual analogue scale global rating. Intra-rater and inter-rater reliability for each index and individual index items were measured using intraclass correlation coefficients (ICCs). Items with high reliability were used to develop the Robarts histopathology index (RHI). The responsiveness/validity of the RHI and multiple histological, endoscopic and clinical outcome measures were evaluated by analyses of change scores, standardised effect size (SES) and Guyatt's responsiveness statistic (GRS) using data from a clinical trial of an effective therapy. RESULTS: Inter-rater ICCs (95% CIs) for the total GS and MRS scores were 0.79 (0.63 to 0.87) and 0.80 (0.69 to 0.87). The correlation estimates between change scores in RHI and change score in GS and MRS were 0.75 (0.67 to 0.82) and 0.84 (0.79 to 0.88), respectively. The SES and GRS estimates for GS, MRS and RHI were: 1.87 (1.54 to 2.20) and 1.23 (0.97 to 1.50), 1.29 (1.02 to 1.56) and 0.88 (0.65 to 1.12), and 1.05 (0.79 to 1.30) and 0.88 (0.64 to 1.12), respectively. CONCLUSIONS: The RHI is a new histopathological index with favourable operating properties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,059
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,125

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,059
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations349
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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