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Enregistrement W2306700691 · doi:10.1534/g3.115.021410

Developmental Function of the PHR Protein RPM-1 Is Required for Learning in<i>Caenorhabditis elegans</i>

2015· article· en· W2306700691 sur OpenAlexaff
Andrew C. Giles, Karla J. Opperman, Catharine H. Rankin, Brock Grill

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésHabituationCaenorhabditis elegansNeuroscienceAxonBiologySynapseMutantLoss functionNervous systemTransgeneBiological neural networkCell biologyGenetically modified mouseGeneticsPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The PAM/Highwire/RPM-1 (PHR) proteins are signaling hubs that function as important regulators of neural development. Loss of function in Caenorhabditis elegans rpm-1 and Drosophila Highwire results in failed axon termination, inappropriate axon targeting, and abnormal synapse formation. Despite broad expression in the nervous system and relatively dramatic defects in synapse formation and axon development, very mild abnormalities in behavior have been found in animals lacking PHR protein function. Therefore, we hypothesized that large defects in behavior might only be detected in scenarios in which evoked, prolonged circuit function is required, or in which behavioral plasticity occurs. Using quantitative approaches in C. elegans, we found that rpm-1 loss-of-function mutants have relatively mild abnormalities in exploratory locomotion, but have large defects in evoked responses to harsh touch and learning associated with tap habituation. We explored the nature of the severe habituation defects in rpm-1 mutants further. To address what part of the habituation circuit was impaired in rpm-1 mutants, we performed rescue analysis with promoters for different neurons. Our findings indicate that RPM-1 function in the mechanosensory neurons affects habituation. Transgenic expression of RPM-1 in adult animals failed to rescue habituation defects, consistent with developmental defects in rpm-1 mutants resulting in impaired habituation. Genetic analysis showed that other regulators of neuronal development that function in the rpm-1 pathway (including glo-4, fsn-1, and dlk-1) also affected habituation. Overall, our findings suggest that developmental defects in rpm-1 mutants manifest most prominently in behaviors that require protracted or plastic circuit function, such as learning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,328
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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