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Enregistrement W2306930147 · doi:10.1089/ind.2015.0031

Expression and Characterization of Glycosyl Hydrolase Family 115 α-Glucuronidase from <i>Scheffersomyces stipitis</i>

2016· article· en· W2306930147 sur OpenAlex
Paramjit K. Bajwa, Sean C. Harrington, Mehdi Dashtban, Hung Lee

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueIndustrial Biotechnology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésChemistryPichia pastorisBiochemistryXylanEnzyme assayEnzymePichia stipitisGlycosylXyloseHydrolysisChromatographyRecombinant DNAFermentation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gene encoding glycosyl hydrolase family 115 α-glucuronidase from Scheffersomyces stipitis (ssagu115) was cloned and expressed in Pichia pastoris strain X33. The recombinant enzyme was purified to homogeneity by Ni-chelation affinity chromatography. The apparent molecular weight of the secreted recombinant enzyme was about 150 kDa as determined by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. The recombinant α-glucuronidase was able to remove 4-O-methylglucuronic acid groups from several polymeric xylans (beech, birch, and oat spelt xylan) as well as xylooligosaccharides (aldotetraouronic acid and aldopentaouronic acid). The enzyme was more active towards xylooligosaccharides than xylans. Substrate inhibition was observed with aldouronic acids at concentrations above 23 mM. The Km values of the enzyme towards aldotetraouronic and aldopentaouronic acids were 8.2 mM (5 mg/mL) and 9 mM (6.5 mg/mL), respectively. For beech and birch xylan, the Km values were 9.5 mg/mL and 35 mg/mL, respectively. The enzyme was active over the pH range of 3.0–8.5, with maximal activity at pH 4.0. The optimum temperature for activity of the enzyme was 50°C. The enzyme exhibited synergy with endoxylanases from the GH10 and GH11 families on hydrolysis of beech xylan, birch xylan, and oat spelt xylan, with the greatest synergistic effect being shown with the GH10 endoxylanase. Treatment of polymeric xylan with SsAgu115 led to reduced solubility and increased precipitation from solution. Insoluble xylans have the potential to form hydrogels, which may have pharmaceutical and biomedical applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,583

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle