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Enregistrement W2307668285 · doi:10.1186/s12967-016-0837-5

Single nucleotide polymorphisms in apoptosis pathway are associated with response to imatinib therapy in chronic myeloid leukemia

2016· article· en· W2307668285 sur OpenAlexaff
Qiaoli Zheng, Jiang Cao, Nada Hamad, Hyeoung‐Joon Kim, Sang Kyun Sohn, Chul Won Jung, Jeffrey H. Lipton, Dennis Dong Hwan Kim

Notice bibliographique

RevueJournal of Translational Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImatinibApoptosisGenotypeSingle-nucleotide polymorphismMyeloid leukemiaFas ligandFas receptorMedicineCancer researchImmunologyOncologyBiologyProgrammed cell deathGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The mechanism of action of imatinib is known to involve the Fas-mediated apoptosis pathway. Consequently inter-individual variations in this apoptosis pathway might be associated with imatinib response or resistance. METHODS: This study attempted to focus on eight genotypes in the apoptosis pathway including FAS (rs1800682, rs2229521, rs2234767 and rs2234978), FASLG (rs763110), CASP10 (rs13006529), and APAF1 (rs1439123, rs2288713) and analyzed their association with treatment outcomes including molecular response with 4.5 log reduction (MR4.5), following imatinib therapy in 187 Korean CML patients. RESULTS: The GG/GA genotype in FAS (rs2234767) showed a higher rate of MR4.5 than the AA genotype (at 5 years 59.7 vs 37.4 %, p = 0.013). Using a bootstrap procedure for internal validation we confirmed that FAS (rs2234767) correlates with MR4.5 (p = 0.050). Multivariate analysis confirmed that the FAS genotype (rs2234767) is an independent surrogate for MR4.5 (p = 0.019, HR 0.43, 95 % CI [0.22-0.87]). CONCLUSIONS: The Fas/FasL signaling pathway may represent the major pathway that mediates apoptosis in CML treated with imatinib. SNP markers in the apoptosis pathway including FAS genotype (rs2234767) can be potential surrogates for predicting deeper molecular response after imatinib therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,779
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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