Mitochondrial and microsatellite DNA diversity throughout the range of a cold adapted freshwater salmonid : phylogeography, local population structure and conservation genetics of Arctic grayling (Thymallus arcticus) in North America
Notice bibliographique
Résumé
The distributions of most Holarctic freshwater fish species were severely altered and restricted during the many glaciation events that have occurred throughout the Pleistocene. Isolation of groups of fish into distinct glacial refugia provided the opportunity for genetic divergence during these periods of allopatry through genetic drift and novel selection pressures. In this thesis, I examined the signature of such isolation and postglacial range expansion in the Arctic grayling (Thymallus arcticus) by assaying mitochondrial and microsatellite (nuclear) DNA variation throughout the species' range in North America. I also examined local population structure in the Peace River, British Columbia, because local demographics are integral to a species' phylogeographic structure. I found a dramatic decline in genetic diversity from Alaska to the southeast, which suggests Arctic grayling survived the last ice age in Beringia then bottlenecks and founder events reduced diversity during southward postglacial range expansion. Genetic similarities among regions suggest that Arctic grayling survived glaciation in three refugia north of the ice sheets and in one region south of the ice sheets. A north Beringian lineage dispersed south during the Wisconsinan glaciation and founded populations in an upper Missouri River glacial refuge. These upper Missouri grayling dispersed north postglacially, and founded populations in Saskatchewan and eastern British Columbia. A south Beringian lineage dispersed south from the Yukon River Valley as far as the Peace and Stikine rivers in British Columbia. A third lineage from the Nahanni Valley in the Northwest Territories was more locally distributed in the Mackenzie drainage between Great Slave Lake and the lower Liard River. Population subdivision in the Peace River strongly suggests that Arctic grayling home to their natal stream to spawn. Such local population subdivision and low genetic diversity throughout the species range suggest that Arctic grayling habitat is partitioned among small isolated effective population sizes. Genetic diversity is distributed among lineages on a large geographic scale, and among populations on a local geographic scale. Consequently, to preserve the evolutionary potential of Arctic grayling, several populations within a watershed, several watersheds within a lineage, and several lineages within their geographic range must be prioritized for conservation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».