The evolution of affinity maturation: Germinal center-like cell aggregates in fish (81.16)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Compared with mammals, fish and amphibians have a limited antibody affinity maturation response, an outcome attributed to their lacking distinguishable germinal centres. There is evidence of Ig hypermutation and antigen driven selection, and as such we’d anticipate some sort of germinal center (GC)-like structures, perhaps akin to the varied GC-like cell aggregates observed in different human autoimmune disease. To establish whether fish have GC-like cell aggregates we did in situ hybridization and laser capture microscopy coupled with gene expression analyses on spleen sections of BSA immunized channel catfish. AID expressing cells were found predominantly in tight association with so called melano-macrophage centers or clusters (MMCs). Melano-macrophages have previously been noted for their ability to capture and retain whole antigen and thus had been proposed to be functionally analogous to follicular dendritic cells. Though far smaller than mammalian GCs the fish MMCs also contain CD4 expressing cells and a few flanking plasma cells. However TUNEL assays did not reveal the expected numbers of surrounding apoptotic cells. While there are alternative theories as to the function of these cell aggregates we are proposing that they are primitive germinal centers. Funded by the National Science and Engineering Research Council - Canada
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».