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Enregistrement W2309134523 · doi:10.1093/ofid/ofu052.283

417Comparison of ESBL rates and susceptibility of E. coli from IAI in the USA, Canada, and Mexico 2009-2013

2014· article· en· W2309134523 sur OpenAlexaboutno aff
Robert E. Badal, Sibylle Lob, Meredith Hackel, Samuel K. Bouchillon, Aaron Johnson, Daryl J. Hoban, Dan Sahm

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePathogenic organismCefepimeGerontologyDemographyMicrobiologyImipenemAntibioticsAntibiotic resistanceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producing E. coli are multi-drug resistant and pose therapeutic challenges worldwide. This report from the Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART) compares ESBL rates and susceptibility of E. coli from IAI from the USA, Canada, and Mexico in 2009-2013. Methods. 44 laboratories (28 USA, 12 Canada, 4 Mexico) each collected up to 100 consecutive gram-negative organisms from IAI each year; 5,183 of 12,421 (42%) were E. coli. Susceptibility was determined using CLSI broth microdilution methods and breakpoints. Trends in ESBL rates were assessed with the Cochran-Armitage test. Results. From 2009-2013, the proportion of ESBL+ E. coli showed significant increasing trends in all three countries. Susceptibility of selected drugs in 2013 (values ≥90% are shaded) and ESBL rates from 2009-2013 are shown in the table. Sensitivity analysis for the USA using only the 13 sites that submitted isolates in all 5 years confirmed the increasing ESBL rates (6, 6, 10, 6, and 14% in the years 2009-2013); however, a similar analysis for Canada did not find a significant trend (in 5 of 12 sites) in part due to a larger drop in 2013 than in the full analysis (9, 8, 11, 19, 10%). All 4 Mexican sites participated in all 5 years. In 2013, only AMK, ETP and IPM showed %S >90% in all 3 countries against E. coli. The much higher ESBL rate in Mexico corresponded to dramatically lower susceptibility rates than North America to most other drugs. Despite having significantly lower ESBL+ E. coli rates than Mexico, the US and Canada must take steps to contain further spread of these organisms, and Mexico itself must continue efforts (such as restricting fluoroquinolone use) to address this situation in which ESBL+ is the predominant phenotype among E. coli. Conclusion. E. coli ESBL rates were much higher in Mexico, and although all 3 countries showed increasing trends in the full analysis, they appear to be leveling off in Canada and Mexico. Disclosures. R. Badal, Merck: Independent Contractor, Consulting fee S. Lob, Merck: Independent Contractor, Consulting fee M. Hackel, Merck: Independent Contractor, Consulting fee S. Bouchillon, Merck: Independent Contractor, Consulting fee A. Johnson, Merck: Independent Contractor, Consulting fee D. Hoban, Merck: Independent Contractor, Consulting fee D. Sahm, Merck: Independent Contractor, Consulting fee

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,337
Score d'incertitude au seuil0,402

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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