Genomic Instability of the Sex-Determining Locus in Atlantic Salmon (<i>Salmo salar</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Atlantic salmon and rainbow trout, like other members of the subfamily Salmoninae, are gonochoristic with male heterogamety. The finding that sex-linked genetic markers varied between species suggested that the sex-determining gene differs among salmonid species, or that there is one sex-determining gene that has the capacity to move around the genome. The discovery of sdY, the sex-determining gene in rainbow trout, and its presence in many male salmonids gave support to the latter. Additional evidence for a salmonid-specific, sex-determining jumping gene came from the mapping of the sex-determining locus to three different chromosomes in Tasmanian male Atlantic salmon lineages. To characterize the sex-determining region, we isolated three sdY containing BACs from an Atlantic salmon male library. Sequencing of these BACs yielded two contigs, one of which contained the sdY gene. Sequence analysis of the borders of male-specific and female/male common regions revealed highly repetitive sequences associated with mobile elements, which may allow an sdY cassette to jump around the genome. FISH analysis using a BAC or a plasmid containing the sdY gene showed that the sdY gene did indeed localize to the chromosomes where SEX had been mapped in different Tasmanian Atlantic salmon families. Moreover, the plasmid sdY gene probe hybridized primarily to one of the sex chromosomes as would be expected of a male-specific gene. Our results suggest that a common salmonid sex-determining gene (sdY) can move between three specific loci on chromosomes 2, 3, and 6, giving the impression that there are multiple SEX loci both within and between salmonid species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».