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Enregistrement W2310152516 · doi:10.1080/07060661.2016.1150884

Two small secreted proteins from<i>Puccinia triticina</i>induce reduction of ß-glucoronidase transient expression in wheat isolines containing<i>Lr9, Lr24</i>and<i>Lr26</i>

2016· article· en· W2310152516 sur OpenAlexaffvenue
Vanesa Segovia, Myron Bruce, Jessica L. Shoup Rupp, Li Huang, Guus Bakkeren, Harold N. Trick, John P. Fellers

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésHaustoriumRust (programming language)GeneEffectorSecretionHypersensitive responseBiologyPhaseolusSecretory proteinPlant defense against herbivoryPathogenBotanyCell biologyMicrobiologyPlant disease resistanceHost (biology)BiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known about the molecular interaction of wheat and leaf rust (Puccinia triticina Eriks). However, genomic tools are now becoming available so that the host–pathogen interactions can be better understood. Significant efforts are being placed on understanding the secretomes of various pathogens as secreted peptides are believed to be the best candidates for avirulence effectors. In this work, a P. triticina haustorial cDNA library was evaluated for the presence of proteins containing secretion signals. Ten predicted proteins were found in the library, of which two were expressed in haustorial fractions. Three of the secreted proteins, Pt3, Pt12 and Pt27, were used in biolistic experiments to determine whether they could induce hypersensitive cell death, which is commonly observed in incompatible rust interactions with wheat leaf rust resistance genes. When Pt3 was co-bombarded with a β-glucoronidase (GUS)-expressing vector into wheat isolines with resistance genes Lr9 or Lr24, a significant reduction of GUS expression was observed, presumably due to hypersensitive cell death. In other co-bombardment experiments, Pt27 induced a significant reduction in GUS expression in the Lr26 isoline. These results suggest that Pt3 and Pt27 may function in avirulence against wheat leaf rust in resistant genotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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