Identification of amino acid variation in the prion protein associated with classical scrapie in Canadian dairy goats
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A clear association of amino acid variation in the prion protein gene (PRNP) with susceptibility and resistance to classical scrapie exists in sheep, but not in goats. In this study we examined DNA sequence variation in the PRNP of 149 animals from two scrapie-infected herds of Saanen dairy goats, and identified 6 non-synonymous variants in the coding region. RESULTS: In the larger herd, all of the 54 scrapie-affected goats tested had at least one allele with the arginine (R) codon at position 211, with 52 being homozygous for that variant. No animal homozygous for the glutamine (Q) codon at 211 were affected and only two heterozygotes (R/Q) were affected. A weak association was found at position 146 and no significant associations were found with amino acid variation at the remaining four variant positions (142, 143, 222 and 240), however, the allelic variation was low. Similar patterns were observed in the second scrapie-affected herd. CONCLUSION: We also evaluated previous studies on goat herds affected with scrapie and this relationship of R susceptibility and Q resistance at 211 was present independent of the genotypes at the other positions including 222. The fact that glutamine at 211 provides a significant protective property to scrapie irrespective of the other positions could be important for breeding strategies aimed at improving herd resistance to scrapie, while maintaining important productivity traits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».