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Enregistrement W2311320969 · doi:10.3899/jrheum.150665

Response to Intravenous Cyclophosphamide Treatment for Lupus Nephritis Associated with Polymorphisms in the<i>FCGR2B-FCRLA</i>Locus

2016· article· en· W2311320969 sur OpenAlexvenueno aff
Kwang-Woo Kim, So‐Young Bang, Young Bin Joo, Taehyeung Kim, Hye‐Soon Lee, Changwon Kang, Sang‐Cheol Bae

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésLupus nephritisSingle-nucleotide polymorphismMedicineSNPLocus (genetics)Genome-wide association studyMinor allele frequencyCyclophosphamideSystemic lupus erythematosusImmunologyGenetic associationGenotypePharmacogenomicsGeneticsInternal medicineBiologyGenePharmacologyDiseaseChemotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Cyclophosphamide (CYC) is an immunosuppressant drug widely used to treat various diseases including lupus nephritis, but its efficacy highly varies from individual to individual. This pharmacogenomics association study searched for genetic variations associated with CYC efficacy. METHODS: Genome-wide association scan was performed for 109 Korean patients with systemic lupus erythematosus with lupus nephritis (classes III-V) who received intravenous CYC induction therapy. Genetic differences between responders and nonresponders were examined using Cochran-Armitage trend tests, and genotype imputation was used for defining the association locus. RESULTS: Genetic polymorphisms in the Fcγ receptor gene (FCGR) cluster at human chromosome 1q23, previously associated with lupus nephritis susceptibility, were associated with the response to CYC treatment for lupus nephritis. Significant response association was found for 3 perfectly correlated (r(2) = 1) single-nucleotide polymorphisms (SNP): rs6697139, rs10917686, and rs10917688, located between the FCGR2B and FCRLA genes (p = 3.4 × 10(-8)). Carriage of the minor alleles in these SNP was found only in nonresponders (31%) and none in responders (0%). CONCLUSION: This first genome-wide association approach for CYC response yielded a robust profile of genetic associations including large-effect SNP in the FCGR2B-FCRLA locus, which may provide better insights to CYC metabolism and efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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