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Enregistrement W2311813521 · doi:10.1136/jclinpath-2015-202955

<i>CD10-positive mantle cell lymphoma</i>: biologically distinct entity or an aberrant immunophenotype? Insight, through gene expression profile in a unique case series

2015· article· en· W2311813521 sur OpenAlexaff
Ariz Akhter, Etienne Mahé, Lesley Street, Payam Pournazari, Marco Perizzolo, Meer‐Taher Shabani‐Rad, Douglas A. Stewart, Adnan Mansoor

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSomatic hypermutationMantle cell lymphomaImmunophenotypingLymphomaBiologyGerminal centerGene expression profilingGenePathologyCancer researchGene expressionB cellBioinformaticsMedicineGeneticsImmunologyAntibodyFlow cytometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mantle cell lymphoma (MCL) is an aggressive disease with genetic heterogeneity and discrete clinical subtypes. MCL is rarely CD10 positive. These cases raise the question whether a subset of MCL may be germinal centre (GC) derived, and have distinct clinicopathological characteristics. AIMS AND METHODS: A series of nine CD10-positive MCL cases is described herein. The clinicopathological and immunophenotypic features, immunoglobulin somatic hypermutation (SHM) status and gene expression profile (GEP) data are detailed. These features were compared with two independent sets (n=20, each) of CD10-negative MCL cases (controls), which were randomly selected from our institutional registry. RESULTS: GEP showed distinct expression of a GC signature in CD10-positive MCL cases with minimal impact on downstream signalling pathways. There were no significant differences in the clinicopathological features or clinical outcome between our CD10-positive and CD10-negative MCL cases. The frequency of SHM was comparable with established data. CONCLUSIONS: This study provides convincing evidence that CD10 expression is related to a distinct GC signature in MCL cases, but without clinical or biological implications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,555

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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