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Enregistrement W2312246075 · doi:10.1158/1557-3265.hemmal14-b08

Abstract B08: eIF4E3 forms a novel cap-binding complex for mRNA translation initiation.

2015· article· en· W2312246075 sur OpenAlexaff
Ari L. Landon, Parameswary A. Muniandy, Simone Houng, Amol C. Shetty, Kevin G. Becker, Katherine L. B. Borden, Ronald B. Gartenhaus

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEIF4GEIF4EeIF4AEukaryotic translationBiologyInternal ribosome entry siteMessenger RNATranslation (biology)RNA-binding proteinInitiation factorCell biologyEukaryotic initiation factorTranslational regulationUntranslated regionMolecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dysregulation of mRNA translation can alter the cellular phenotype leading to cancer initiation, maintenance, progression, invasion or metastasis. Cap-dependent translation is the primary mechanism of mRNA translation in eukaryotic cells. The conventional cap-binding complex, eIF4F consists of three components including eIF4A, eIF4G and eIF4E1. eIF4E1 binds the 7-methyl-guanosine-cap (cap) structure in the mRNA and functions to bridge mRNA to the ribosome. eIF4E3 is another member of the eIF4E family that has been recently shown to bind cap using biophysical approach. We explored the biological function of eIF4E3 in a diffuse large B-cell lymphoma model. We found that in the absence or lack of eIF4E1 phosphorylation, eIF4E3 expression is enhanced, and this increases the cap-binding ability of eIF4E3. We find that eIF4E3 also physically associates with the components of the cap-binding complex eIF4A and eIF4G, essentially forming a novel cap-binding complex. We interrogated the functional capacity of the eIF4E3-mediated translation by analyzing the translatome and transcriptome of eIF4E3 expressing cells. eIF4E3 and eIF4E1 mutually regulate a high fraction of total mRNA transcripts, while exclusively modulating translation of select messages. Interestingly, we identified selective motif enrichments in the 5'UTR that may facilitate transcript selection by eIF4E1 or eIF4E3. Together, we have identified a novel cap-binding complex consisting of eIF4A, eIF4G and eIF4E3, which can initiate mRNA translation of select messages. Citation Format: Ari L. Landon, Parameswary A Muniandy, Simone Houng, Amol Shetty, Kevin Becker, Katherine Borden, Ronald B. Gartenhaus. eIF4E3 forms a novel cap-binding complex for mRNA translation initiation. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Hematologic Malignancies: Translating Discoveries to Novel Therapies; Sep 20-23, 2014; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2015;21(17 Suppl):Abstract nr B08.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,627
Tête enseignante GPT0,571
Écart entre enseignants0,056 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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