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Enregistrement W2312375425 · doi:10.1093/plankt/fbt123

Phylogenetic diversity of eukaryotic marine microbial plankton on the Scotian Shelf Northwestern Atlantic Ocean

2013· article· en· W2312375425 sur OpenAlexaff
Cindy Dasilva, William K. W. Li, Connie Lovejoy

Notice bibliographique

RevueJournal of Plankton Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensBedford Institute of OceanographyFisheries and Oceans CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiatomPhytoplanktonBiologyNitzschiaPlanktonTaxonDominance (genetics)OceanographySynechococcusPhylogenetic treeEcologyCladeBloomCyanobacteriaNutrientGeologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phytoplankton on the Scotian Shelf (SS) are well studied using microscopy and flow cytometry (FCM). These tools provide a picture of a diatom dominated spring bloom, and summer–autumn communities dominated by the cyanobacterium Synechococcus. FCM studies have shown that non-diatom microbial eukaryotes are present throughout the year, but the diversity and seasonality of these often smaller difficult to identify species are not well known. We investigated the taxonomic identity of surface and sub-chlorophyll maxima communities, using cloning and sequencing of the 18S rRNA gene, in April and October, along two inshore to offshore transects. Here, we report new taxonomic records and evidence of novel taxa in this well-studied system. For example, during April, previously unreported Phaeocystis spp. were recovered and picophytoplankton 'patches' identified from FCM were marked by the Bolido-Parmales complex. The October communities were phylogenetically diverse with chlorophytes more prevalent. Among heterotrophic taxa, choanoflagellates were characteristic of April along with two clades of uncultivated marine stramenopiles (MAST) clades; MAST-7 and MAST-1. In contrast, MAST-4 was more prevalent in October. There were also onshore versus offshore differences, with the April offshore communities more similar to October communities, reflecting nutrient draw-down and a post-bloom community offshore in April.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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