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Enregistrement W2312686369 · doi:10.1021/cg4012394

Effects of Full-Length Phosphorylated Osteopontin and Constituent Acidic Peptides and Amino Acids on Calcite Dissolution

2014· article· en· W2312686369 sur OpenAlexaff
Valentin Nelea, Yung‐Ching Chien, Jeanne Paquette, Marc D. McKee

Notice bibliographique

RevueCrystal Growth & Design · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalcitePhosphoserineChemistryAmino acidDissolutionSerinePeptidePhosphateAqueous solutionBiochemistryBiophysicsPhosphorylationCrystallographyMineralogyOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mineral dissolution events are part of the life history of many protein-rich biomineralized tissues and structures. To assess under dissolution conditions the specificity of interactions between calcite and phosphate moieties in proteins, the ( 1 0 4 ) surface of calcite single crystals were etched with aqueous solutions containing osteopontin (OPN) protein and examined by atomic force microscopy. Etch pits were compared to those modified by constituent acidic peptides of OPN as well as by single relevant amino acids. Exposure to phosphorylated OPN and phosphorylated acidic serine- and aspartate-rich motif (ASARM) peptides of OPN produced oval or nearly circular etch pits (rather than the rhombic shape when etched in water alone) in the ( 1 0 4 ) calcite surface, with a steep acute [ 0 1 0 ] edge, indicating preferential step-specific binding. A carboxyl-group-rich polyaspartic acid peptide, and the nonphosphorylated ASARM peptide, produced pits predominantly elongated parallel to [ 4 2 1̅ ]. Etch-pit steps parallel to [ 0 1 0 ] were stabilized by the amino acids aspartic acid and phosphoserine, but not by serine. OPN and peptides bearing multiple acidic groups modified pits at concentrations several hundred times lower than did the amino acids alone. Molecule phosphorylation consistently induced step edge rounding, suggesting phosphate-carboxyl cooperative binding to calcium ions at the ( 1 0 4 ) calcite surface and step edges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,206
Score d'incertitude au seuil0,715

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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