Mitochondrial genome sequences of representatives of three families of scorpionflies (Order Mecoptera) and evolution in a major duplication of coding sequence
Notice bibliographique
Résumé
The complete mitochondrial DNA sequences of a hangingfly, Bittacus pilicornis (Mecoptera: Bittacidae), a snow scorpion fly, Boreus elegans (Mecoptera: Boreidae), and a nearly complete sequence from another scorpionfly species, Microchorista philpotti (Mecoptera: Nannochoristidae) were determined. The coding sequence of all three genomes includes the 37 genes normally found in insect mtDNAs, in the same gene order as first described in Drosophila. In addition to the standard set of genes, the Microchorista sequence includes a large duplication of the coding region. The duplication is at least 4 kb (and may be much larger) and includes the remnants of three protein-coding genes and seven tRNA genes. The duplication evidently arose as a single event, and the duplicated region can be aligned in its entirety with the corresponding region of the functional genome. Although most of the genes contain defects that render them nonfunctional, analysis shows that the protein-coding genes in the duplicated region evolved for a considerable period under constraints expected of functional protein-coding genes. It is evident, therefore, that for a period two copies of some of the mitochondrial genes were functional in this species, including genes coding for proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».