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Enregistrement W2313411518 · doi:10.5539/jmbr.v6n1p20

Genetic Diversity of Rhizobia Nodulating Alfalfa in Iraq as a Source of More Efficient Drought Tolerance Strains

2016· article· en· W2313411518 sur OpenAlexvenueno aff
Rana A. Hameed Hameed, Nidhal N. Hussain, Abd aljasim Muhisen Aljibouri

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRhizobiaSinorhizobium melilotiSinorhizobiumDrought toleranceGenetic diversityPopulationAgronomyFodderVeterinary medicineBotanyNitrogen fixationBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sinorhizobium meliloti is a gram-negative, soil bacteria, which gain a huge importance deserved to their capability in fixing nitrogen symbiotically with an important fodder crop legume-alfalfa (Medicago sativa). This study aims to (i): isolate indigenous Sinorhizobium meliloti from different field sites in Iraq; (ii): assess the isolates tolerance to induced water shortage using polyethylene glycol-6000; (iii): evaluate genetic diversity and genetic relationships among isolates of natural population with drought tolerant abilities. Drought tolerance analysis disclose great variations between Sinorhizobium isolates, the highest tolerant isolates to drought were 12 from whole thirty (40%), endured from -3 up to -4 MPa(Mega pascal), at the same time the drought sensitive isolates tolerated up to -1.5 MPa, but for isolate Bs58 which tolerated up to -1 MPa. The growth decrease with the increase of drought stress. REP-PCR method was an excellent technique to distinguish between the S. isolates based on their tolerance to different water potential levels, the REP-PCR gave a significant band about 700bp (base pair) in size, which were present in all drought moderate and tolerant isolates, while this band was absent in all drought sensitive isolates(except one isolate). Also the ERIC-PCR method cleared the absence of two significant bands 300bp and 600bp from all drought sensitive isolates. UPGMA analysis based on rep-PCR revealed two groups branching at a similarity of 35%, first group included only one isolate Bs16, which was a drought moderate tolerant; second group contained the rest of isolates, yet the latter splits into two subgroups with 68% similarity; the first subgroup comprised all sensitive isolates with 80% similarity among them, the second subgroup included the tolerant and moderate isolates with similarity 88%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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