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Enregistrement W2313507970 · doi:10.1158/1538-7445.am10-12

Abstract 12: Metastatic neuroblastoma cancer stem cells display a mixed phenotype of tumor and niche origin required for survival

2010· article· en· W2313507970 sur OpenAlexaff
Loen M. Hansford, Olena Morozova, Tatiana Lipman, Kim M. Blakely, Miki Ohira, Paula Marrano, Paola Angelini, Jason Moffat, Carol J. Thiele, Paul S. Thorner, John E. Dick, Akira Nakagawara, Meredith S. Irwin, Marco A. Marra, David R. Kaplan

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchPathologyMetastasisCancer stem cellNeural crestCancerLineage markersHaematopoiesisBone marrowStem cellNeuroblastomaNestinProgenitor cellNeural stem cellImmunologyMedicineCell cultureGeneCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuroblastoma (NB) is a pediatric tumor of neural crest origin, and is the most common cancer of infancy. 50% of patients have metastases at diagnosis, of which 85% will die after multiple relapses from metastatic disease. We identified tumor-initiating cells (TICs) from bone marrow (BM) metastases of high-risk patients that are propagated as spheres and that have many properties of cancer stem cells, and form NB in mice with as few as 1 cell. To understand patient relapse and disease progression, we compared NB-TICs from BM with those from tumor and brain metastases and SKPs, a normal pediatric stem cell counterpart, by cDNA microarray, flow cytometry, and whole genome shotgun sequencing transcriptome analysis. BM-derived NB-TICs expressed primitive neural crest and neuronal markers as well as hematopoietic markers from primitive, myeloid, and B-cell lineages and contained VDJ gene rearrangements, which are normally associated with B-cell leukemias. Hematopoietic genes were not expressed or expressed at very low levels in tumor-derived sphere lines and a line from an NB brain metastasis, however brain metastasis-derived TICs expressed CD133, while BM-derived NB-TICs did not. Furthermore, we found that shRNA to CD74, which is upregulated in B-cell lymphoma and multiple myeloma and is a therapeutic target for those cancers, induced the rapid death of NB-TICs but not normal SKPs. Interestingly cells co-staining for the hematopoietic markers CD45 or CD74 and the neural neural progenitor marker nestin were found in BM smears of patients with relapsed NB in the bone marrow. We suggest that metastatic TICs from some tumors adopt resident niche-specific gene expression signatures, which may aid diagnosis and the development of novel treatments. We hypothesize that drugs used for leukemia may be efficacious therapeutics for metastatic NB, and are currently testing this hypothesis in mouse models. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 12.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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