MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2313648546 · doi:10.1021/pr500659r

Metabolomics Reveals the Sex-Specific Effects of the SORT1 Low-Density Lipoprotein Cholesterol Locus in Healthy Young Adults

2014· article· en· W2313648546 sur OpenAlexafffund
Matthias S. Klein, Kimberly Connors, Jane Shearer, Hans J. Vogel, Dustin S. Hittel

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Innovates - Health SolutionsAlberta Cancer Foundation
Mots-clésMetabolomicsLocus (genetics)CholesterolBiologyLipoproteinGeneticsLdl cholesterolComputational biologyBioinformaticsGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolite profiles of individuals possessing either the cardiovascular risk or protective variants of the low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) associated 1p13.3 locus of the SORT1 gene (rs646776) were analyzed. Serum metabolites and lipids were assessed using LC-MS-based metabolomics in a healthy young population (n = 138: 95 males, 43 females). Although no significant differences were observed in the combined cohort, divergent sex effects were identified. Females carrying the protective allele showed increased phosphatidylcholines, very long chain fatty acids (>C20), and unsaturated fatty acids. Unsaturated fatty acids are considered to be protective against cardiovascular disease. In contrast, males carrying the protective allele exhibited decreased long-chain fatty acids (≤C20) and sphingomyelins, which is similarly considered to decrease cardiovascular disease risk. No significant changes in clinically assessed lipids such as LDL-C, high-density lipoprotein (HDL-C), total cholesterol, or triglycerides were observed in females, whereas only LDL-C was significantly changed in males. This indicates that, apart from reducing LDL-C, other mechanisms may contribute to the protective effect of the SORT1 locus. Thus, the analysis of metabolic biomarkers might reveal early disease development that may be overlooked by relying on standard clinical parameters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,700
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Proteome ResearchMême sujetLipoproteins and Cardiovascular HealthTravaux en français237 207