Mitsunobu Reaction on Solid Support for Peptide N-terminal Farnesylation
Notice bibliographique
Résumé
Prenylation is an important post-translational modification of peptide structures. For example, farnesylated and geranylgeranylated peptides and proteins bind to cell membranes by way of the prenyl subunit. Prenylation is involved in a wide variety of biological process and diseases, including cancer [1,2] and Alzeimer’s disease [2]. Prenylated peptides have been shown to be generally non-toxic and to exhibit cell permeable properties [3]. Prenylated protein libraries have been used to study various biochemical mechanisms that involve posttranslational prenylation [4]. Prenylated peptides have also been used as prenyltransferase inhibitors [5]. Prenylated peptides may exhibit ability to localize in membranes, which may enhance their metabolic stability and biological presentation. The conventional way to introduce a prenyl group onto a peptide chain involves nucleophilic displacement by a cysteine residue thiol side chain on a proper prenyl bromide [3]. Prenyl bromides are relatively expensive and unstable. Prenylation on nitrogen has been less well studied, but may offer an alternative way for introducing the lipid moiety onto peptides. In an effort to explore N-terminal prenylation, we have explored the Mitsunobu reaction in order to employ the relatively more stable alcohols instead of their prenyl halide counterparts. For this study, the L-enantiomer (L-PDC-31, Ile-Leu-Gly-His-Cit-Asp-Tyr-Lys) of the D-peptide PDC-31 was chosen [6], in part because this prostaglandin F2α receptor modulator has completed successfully phase 1b clinical trials in which toxicity was assessed in women suffering from primary desmenorea [7]. Hypothesizing that the L-isomer may be active, yet rapidly degraded in biological tissues, a farnesyl chain at the N-terminal nitrogen has been examined to increase metabolic stability of the peptide. Herein, the Mistunobu reaction has been employed to farnesylate a solid supported peptide using farnesol as a shelf stable and relatively inexpensive reagent in order to prepare farnesyl peptide 4.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».