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Enregistrement W2314201732 · doi:10.3727/096504011x13021877989793

Evaluation of an <SUP>18</SUP>F-Labeled Oligonucleotide Probe Targeting <I>p21<SUP>WAF1</SUP></I> Transcriptional Changes in Human Tumor Cells

2011· article· en· W2314201732 sur OpenAlexaff
Ingrid L. Koslowsky, Soraya Shahhosseini, Razmik Mirzayans, David Murray, John R. Mercer

Notice bibliographique

RevueOncology Research Featuring Preclinical and Clinical Cancer Therapeutics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfectionMolecular biologyOligonucleotideBiologyLiposomeIntracellularCytoplasmCell cultureCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability to image gene expression using 18F-labeled antisense oligonucleotides (asODNs) directed to specific mRNA transcripts during, or immediately following, radio- or chemotherapy would be a valuable clinical tool to monitor the early tumor response to treatment. Imaging of upregulated p21 mRNA postirradiation using 18F-labeled asODNs could offer insights into early tumor responses by detecting signs of accelerated cellular senescence. Thus, the aim of this work was to evaluate the uptake and distribution of a (radio)-fluorinated asODN in vitro in HCT116 p21(+/+) human colon carcinoma cells, asODN and a random sequence oligonucleotide (rsODN) were conjugated with a (radio)fluorine prosthetic group. Irradiated HCT116 cells were treated with naked or liposome-transfected ODNs. Cell fractionation, confocal microscopy, immunofluorescence, and Western blot studies were performed to observe uptake, distribution, and antisense activity of the probes. [F]asODN demonstrated similar antisense binding ability as the unlabeled asODN to p21 mRNA. Liposomal-transfected 18F-labeled asODNs and rsODNs exhibited a three-to fivefold increase in uptake at 2.5 h compared to the naked [18F]ODNs. Distribution of transfected [18F]asODN in the cytoplasm and endosomes increased over time whereas no change in intracellular distribution was observed with transfected [18F]rsODN or naked ODNs. Antisense activity was not compromised with the addition of a fluorine moiety on asODN. The cellular accumulation and distribution of the (radio)fluorinated ODNs was not altered by the addition of the prosthetic group. Radiolabeled ODNs were able to penetrate the cell with preferential uptake observed with the liposome-transfected probes. Increased distribution of [18F]asODN in the cytoplasm suggests the probe is available for targeting its transcript mRNA. This warrants further investigations into the potential of [18F]asODN to image accelerated senescence postirradiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,305
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,181
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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