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Enregistrement W2314361780 · doi:10.5301/jn.2010.5707

Interstitial fluid obtained from kidney biopsy as new source of renal biomarkers

2010· article· en· W2314361780 sur OpenAlexfundno aff
Riccardo Magistroni, Cantu’ Marco, Giulia Ligabue, Mario Masellis, Enzo Spisni, Luciana Furci, Valentina Lupo, Filippo Genovese, Fabrizio Cavazzini, A Albertazzi

Notice bibliographique

RevueJournal of Nephrology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicinePathologyKidneyRenal biopsyBiopsyNephrologyBody fluidInterstitial fluidProteomicsTwo-dimensional gel electrophoresisBiological fluidsChromatographyInternal medicineBiologyChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Development of renal biomarkers is required to improve on diagnostic accuracy, prognosis and prediction of response to therapy in renal disease. We describe a new method of obtaining from renal specimens a biologic fluid potentially enriched in secreted proteins. METHODS: A renal biopsy specimen was centrifuged, and the interstitial fluid (IF) obtained was evaluated by SELDI-ToF, 1D and 2D gel electrophoresis. Twelve spots were extracted from the 2D gel and characterized by MALDI-TOF-MS. RESULTS: The SELDI diagrams demonstrated abundant peptide peaks. One-dimensional gel electrophoresis demonstrated the presence of many bands indicating a diversity of proteins in the sample. Comparison of serum to IF demonstrated a number of bands that were not shared, suggesting that the IF is not a simple "replica" of plasma fluid. Employing 2D-PAGE, 418 spots were identified in the IF sample; 12 spots were selected and analyzed by mass spectrometry. CONCLUSIONS: We have described a novel technique to obtain a biologic fluid that contains a significant quantity and diversity of proteins from renal tissue. The procedure to obtain the fluid is simple and easily applicable to standard renal biopsy procedures. This fluid has the potential to identify informative proteins that are more concentrated than in any other renal biologic fluid previously analyzed and strictly related to renal pathophysiology. Future work includes the development of a clinical protocol to identify and validate informative biomarkers that have diagnostic and prognostic value.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,851
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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