Theoretical investigation of the conformational intricacies and thermodynamic functions of noradrenaline
Notice bibliographique
Résumé
Noradrenaline is a neurotransmitter that is involved in various psychological processes. In the neurotransmission process, noradrenaline binds to an adrenergic receptor by forming a complex of hydrogen bonds between its two catechol ring hydroxyl groups and the amino acid residues of adrenergic receptors. Although the two catechol ring hydroxyl groups play a crucial role in making hydrogen bonds to the binding site of the adrenergic receptor, the contribution of the catechol ring hydroxyl groups to the intramolecular stability that may affect docking has not been fully studied. To reveal the specific role that the catechol ring hydroxyl groups might play in stabilizing noradrenaline, the quantum chemical computations of geometry optimization and thermodynamic functions of N-protonated noradrenaline conformers were performed at both the B3LYP/6–31G(d,p) and G3MP2B3 levels of theory, using the Gaussian 03 program. The results were compared with those of N-protonated β-hydroxy-β-phenylethylamine, which is identical to noradrenaline except it lacks two catechol ring hydroxyl groups. For the first time, post-Hartree–Fock computations were used to obtain thermodynamic functions to establish relative stabilities of all possible conformers of N-protonated noradrenaline. In this study, 18 distinct structures of N-protonated noradrenaline were revealed, and the catechol ring hydroxyl groups were found to affect noradrenaline stability positively or negatively depending on the conformational orientations. On the basis of available experimental results, the issue that the least stable conformation of two catechol ring hydroxyl groups may be involved in the docking process has been raised. These findings may be useful in synthesis of derivatives of noradrenaline in drug design.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».