Structural characterization of human cholesterol 7α-hydroxylase
Notice bibliographique
Résumé
Hepatic conversion to bile acids is a major elimination route for cholesterol in mammals. CYP7A1 catalyzes the first and rate-limiting step in classic bile acid biosynthesis, converting cholesterol to 7α-hydroxycholesterol. To identify the structural determinants that govern the stereospecific hydroxylation of cholesterol, we solved the crystal structure of CYP7A1 in the ligand-free state. The structure-based mutation T104L in the B' helix, corresponding to the nonpolar residue of CYP7B1, was used to obtain crystals of complexes with cholest-4-en-3-one and with cholesterol oxidation product 7-ketocholesterol (7KCh). The structures reveal a motif of residues that promote cholest-4-en-3-one binding parallel to the heme, thus positioning the C7 atom for hydroxylation. Additional regions of the binding cavity (most distant from the access channel) are involved to accommodate the elongated conformation of the aliphatic side chain. Structural complex with 7KCh shows an active site rigidity and provides an explanation for its inhibitory effect. Based on our previously published data, we proposed a model of cholesterol abstraction from the membrane by CYP7A1 for metabolism. CYP7A1 structural data provide a molecular basis for understanding of the diversity of 7α-hydroxylases, on the one hand, and cholesterol-metabolizing enzymes adapted for their specific activity, on the other hand.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».