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Enregistrement W2314687456 · doi:10.1042/bj20120722

Misprocessing and functional arrest of microRNAs by <i>miR-Pirate</i>: roles of <i>miR-378</i> and <i>miR-17</i>

2012· article· en· W2314687456 sur OpenAlexafffund
Zhaoqun Deng, Xiangling Yang, Ling Fang, Zina Jeyapalan Rutnam, Burton B. Yang

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSunnybrook Research Institute
Mots-clésmicroRNAConstruct (python library)BiologyComputational biologyRNAGeneGene silencingGene expressionCell biologyGeneticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

miRNAs (microRNAs) are short non-coding RNAs that can regulate gene expression in cancer development, which makes them valuable targets for therapeutic intervention. In the present study we report on an approach that can not only arrest the functions of mature miRNAs by binding to them, but it can also induce the 'mis-processing' of the target miRNA, producing a non-functional truncated miRNA. This approach involves generating an expression construct that produces an RNA fragment with 16 repeat sequences. The construct is named miR-Pirate (miRNA-interacting RNA-producing imperfect RNA and tangling endogenous miRNA). The transcript of the construct contained mismatches to the seed region, and thus it would not target the potential targets of the miRNA under study. The homology of the construct is sufficiently high, allowing the transcript to block miRNA functions. The functions of the construct were validated in cell cultures, in tumour formation assays and in transgenic mice stably expressing this construct. To explore the possibility of adopting this approach in gene therapy, we transfected cells with synthetic miR-Pirate and obtained the results we expected. The miR-Pirate, expressed by the construct or synthesized chemically, was found to be able to specifically pirate and silence a mature miRNA through its dual roles and thus could be clinically applied for miRNA intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,757

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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