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Enregistrement W2314720922 · doi:10.1093/neuonc/nov061.118

OT-05 * H3.3-K27M IS A NEGATIVE PROGNOSTIC MARKER IN THALAMIC PEDIATRIC GLIOMA

2015· article· en· W2314720922 sur OpenAlexaff
Scott Ryall, Pawel Buczkowicz, Rahul Krishnatry, Anthony Arnoldo, Paul Steinbok, Uri Tabori, Christina Hawkins

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenBC Children's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGliomaMedicineInternal medicineOncologyNeurosciencePsychologyCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pediatric gliomas are the most commonly diagnosed brain cancer in children, accounting for approximately 50% of all cases. Recently, we conducted genome-analysis of diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG), which specifically arises in the brainstem. Through this, we identified a histone H3.3 mutation (a lysine-methionine substitution at position 27 [K27M]) in approximately 70% of cases. We then showed that H3.3K27M is a negative prognostic marker for DIPG patients independent of histology. We hypothesized a similar prognostic role for H3.3K27M in thalamic gliomas. Utilizing a newly optimized, ultra-sensitive digital droplet PCR assay, we analyzed 38 radiologically confirmed thalamic gliomas (13 low grade and 25 high grade gliomas). Median survival for patients with high grade thalamic gliomas was 1.35 years vs 8.71 years for low grade thalamic glioma patients. Three (23%) low grade and 11 (44%) high grade gliomas tested positive for the H3.3K27M mutation. 31 patients, clinically annotated for treatment, extent of resection, age and outcome were used to determine the prognostic implications of H3.3-K27M. Kaplan-Meier survival analysis revealed significantly worse overall survival of thalamic glioma patients harbouring the H3.3-K27M mutation versus wild type samples (log rank p < 0.001) with a median survival of 1.04 vs 5.81 years for H3.3K27M vs WT thalamic gliomas, respectively. Multivariate cox analysis demonstrated H3.3K27M mutation status to be independent of WHO grade as a predictor of overall survival with a hazard ratio of 6.5 (95% confidence intervals 1.78-24.4, p = 0.005). These findings provide the first evidence that H3.3K27M status is a negative prognostic indicator for thalamic pediatric glioma. Furthermore, we have optimized a digital droplet PCR assay to assess mutation status in small samples, including formalin-fixed paraffin embedded, with high sensitivity and specificity in a clinical setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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