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Enregistrement W2314745102 · doi:10.1021/es501955g

Application of Mass Balance Models and the Chemical Activity Concept To Facilitate the Use of in Vitro Toxicity Data for Risk Assessment

2014· article· en· W2314745102 sur OpenAlexaff
James M. Armitage, Frank Wania, Jon A. Arnot

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensARC Resources (Canada)The Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAmerican Chemistry CouncilUnilever
Mots-clésChemical toxicityBiochemical engineeringBiological systemToxicityMetric (unit)ChemistrySet (abstract data type)In vitroRange (aeronautics)Environmental chemistryComputer scienceEnvironmental scienceToxicologyMaterials scienceBiologyEngineeringBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Practical, financial, and ethical considerations related to conducting extensive animal testing have resulted in various initiatives to promote and expand the use of in vitro testing data for chemical evaluations. Nominal concentrations in the aqueous phase corresponding to an effect (or biological activity) are commonly reported and used to characterize toxicity (or biological response). However, the true concentration in the aqueous phase can be substantially different from the nominal. To support in vitro test design and aid the interpretation of in vitro toxicity data, we developed a mass balance model that can be parametrized and applied to represent typical in vitro test systems. The model calculates the mass distribution, freely dissolved concentrations, and cell/tissue concentrations corresponding to the initial nominal concentration and experimental conditions specified by the user. Chemical activity, a metric which can be used to assess the potential for baseline toxicity to occur, is also calculated. The model is first applied to a set of hypothetical chemicals to illustrate the degree to which test conditions (e.g., presence or absence of serum) influence the distribution of the chemical in the test system. The model is then applied to set of 1194 real substances (predominantly from the ToxCast chemical database) to calculate the potential range of concentrations and chemical activities under assumed test conditions. The model demonstrates how both concentrations and chemical activities can vary by orders of magnitude for the same nominal concentration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,132
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations177
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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