Abstract 617: High-throughput screens identify PARP inhibition as being synthetically lethal with ERCC1 deficiency in non-small cell lung cancer cell lines.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Non-small cell lung cancer (NSCLC) harbors frequent DNA-repair defects that represent therapeutic opportunities. Notably, Excision Repair Cross-Complementation group 1 (ERCC1) deficiency has been described in a subset of tumors and correlated with platinum sensitivity. The use of mechanism-based approaches, such as synthetic lethality, could allow targeting more selectively such DNA repair defects, with reduced systemic toxicity. Methods: To identify ERCC1-selective synthetic lethal interactions, we adopted an integrated functional and molecular profiling approach. An isogenic model of ERCC1-deficient NSCLC cells, consisting of one parental ERCC1-proficient cell line and 3 ERCC1-deficient clones, was functionally profiled by high throughput drug sensitivity screening using a library containing commonly used oncology agents as well as a large number of in-development targeted agents. This was integrated with data from molecular profiling, including high throughput siRNA screens. Results: The comparison of functional viability profiles for ERCC1-deficient models enabled the identification of synthetic lethal effects that could represent therapeutic opportunities for ERCC1-deficient tumors. Notably, ERCC1-deficient cells showed increased sensitivity to several PARP inhibitors, representing promising preliminary results that could be translated in the clinical setting. Mechanistic studies revealed a significant delay in double-strand break repair associated with a G2/M arrest following PARP inhibitor treatment in the ERCC1-deficient population only. Further in vitro work is providing deeper insight into the mechanisms underlying this PARP inhibitors sensitivity and in vivo work is underway. Conclusions: ERCC1-deficiency sensitizes human NSCLC cell lines to PARP inhibitors. In vitro and in vivo revalidations of these results and now underway to further dissect the molecular mechanisms responsible for these ERCC1-deficient selective effects, which could represent therapeutic opportunities. Citation Format: Sophie C. Postel-Vinay, Ilirjana Bajrami, Luc Friboulet, Marieke Aarts, Yari Fontebasso, Fabrice Andre, Ken Olaussen, Jean-Charles Soria, Chris Lord, Alan Ashworth. High-throughput screens identify PARP inhibition as being synthetically lethal with ERCC1 deficiency in non-small cell lung cancer cell lines. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 617. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-617
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».