5-Diethylamino-naphthalene-1-sulfonyl Chloride (DensCl): A Novel Triplex Isotope Labeling Reagent for Quantitative Metabolome Analysis by Liquid Chromatography Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
We describe a new set of isotope reagents, (12)C4-, (12)C2(13)C2-, and (13)C4-5-diethylamino-naphthalene-1-sulfonyl chloride (DensCl), in combination with liquid chromatography Fourier-transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (LC-FTICR-MS), for improved analysis of the amine- and phenol-containing submetabolome. The synthesis of the reagents is reported, and an optimized derivatization protocol for labeling amines and phenols is described. To demonstrate the utility of the triplex reagents for metabolome profiling of biological samples, urine samples collected daily from a healthy volunteer over a period of 14 days were analyzed. The overall workflow is straightforward, including differential isotope labeling of individual samples and a pooled sample that serves a global internal standard, mixing of the isotope differentially labeled samples and LC-MS analysis for relative metabolome quantification. Comparing to the dansyl chloride (DnsCl) duplex isotope reagents, the new triplex DensCl reagents offer the advantages of improved metabolite detectability due to enhanced sensitivity (i.e., about 1000 peak pairs detected by DensCl labeling vs about 600 peak pairs detected by DnsCl labeling) and analysis speed (i.e., simultaneous analysis of two comparative samples by DensCl vs only one comparative sample analyzed by DnsCl).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».