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Enregistrement W2315001336 · doi:10.1152/ajprenal.00638.2013

Accelerated receptor shedding inhibits kidney injury molecule-1 (KIM-1)-mediated efferocytosis

2014· article· en· W2315001336 sur OpenAlexafffund
R. Gandhi, James Yi, Jihyen Ha, Hang Shi, Ola Z. Ismail, Sahra Nathoo, Joseph V. Bonventre, Xizhong Zhang, Lakshman Gunaratnam

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Renal Physiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEfferocytosisCell biologyApoptosisInflammationAcute kidney injuryPhagocytosisChemistryMedicineImmunologyCancer researchBiologyMacrophageInternal medicineBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Efficient clearance of apoptotic cells (efferocytosis) prevents inflammation and permits repair following tissue injury. Kidney injury molecule-1 (KIM-1) is a receptor for phosphatidylserine, an "eat-me" signal exposed on the surface of apoptotic cells that marks them for phagocytic clearance. KIM-1 is upregulated on proximal tubule epithelial cells (PTECs) during ischemic acute kidney injury (AKI), enabling efferocytosis by surviving PTECs. KIM-1 is spontaneously cleaved at its ectodomain region to generate a soluble fragment that serves a sensitive and specific biomarker for AKI, but the biological relevance of KIM-1 shedding is unknown. Here, we sought to determine how KIM-1 shedding might regulate efferocytosis. Using cells that endogenously and exogenously express KIM-1, we found that hydrogen peroxide-mediated oxidative injury or PMA treatment accelerated KIM-1 shedding in a dose-dependent manner. KIM-1 shedding was also accelerated when apoptotic cells were added. Accelerated shedding or the presence of excess soluble KIM-1 in the extracellular milieu significantly inhibited efferocytosis. We also identified that TNF-α-converting enzyme (TACE or ADAM17) mediates both the spontaneous and PMA-accelerated shedding of KIM-1. While accelerated shedding inhibited efferocytosis, we found that spontaneous KIM-1 cleavage does not affect the phagocytic efficiency of PTECs. Our results suggest that KIM-1 shedding is accelerated by worsening cellular injury, and excess soluble KIM-1 competitively inhibits efferocytosis. These findings may be important in AKI when there is severe cellular injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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