MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2315282502 · doi:10.1097/pai.0b013e31822afce2

Significance of Loss of Heterozygosity in Predicting Axillary Lymph Node Metastasis of Invasive Ductal Carcinoma of the Breast

2011· article· en· W2315282502 sur OpenAlexaff
Xiaoqi Lin, Bing Zhu, Sydney Finkelstein, Reda S. Saad, Andrea N. Snitchler, Jan F. Silverman

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreUniversity of TorontoHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesRobert H. Lurie Comprehensive Cancer CenterNorthwestern University
Mots-clésLoss of heterozygosityMetastasisBreast cancerCancer researchCarcinogenesisOncologyLymph nodePrimary tumorEstrogen receptorPathologyBiologyMedicineCancerInternal medicineGeneAlleleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Invasive ductal carcinoma (IDC) of breast metastatic to axillary lymph node (ALN) is a critical factor in determining stage and is a strong predictor of disease prognosis and survival. We studied ALN metastasis using a combined histopathologic/molecular approach to gain insights into the pathobiology implications. Fourteen patients with IDC with positive ALN and 19 with negative ALN were retrieved. Analysis of 17 polymorphic microsatellite repeat markers targeting 1p34-36, 3p24-26, 5q23, 9p21, 10q23, 17p13, 17q12, 17q21, 21q22, and 22q13 was carried out in DNA isolated from primary tumors and metastatic tumors. ALN metastasis correlated with fractional mutation rate of primary and ALN metastatic tumors, primary tumor size, and nuclear grade, and did not correlate with expression of estrogen receptor, progesterone receptor, and Her2/neu. Loss of heterozygosity (LOH) detected at 1p34-36, 3p24-26, 9p21, 10q23, 17p13, 17q12, 21q22, and 22q13 may play an important role in the development and aggressiveness of IDC, and LOHs at 1p34-36, 17p13, and 22q13 may play an important role in metastasis. None of the LOHs were shared by all the tumors, suggesting that IDC develops through various pathways that have unique and personalized patterns of mutational changes, although they share similar morphology. Detection of LOH in IDC is not only useful in studying oncogenesis, but also predicting aggressiveness and ALN metastasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,971

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied immunohistochemistry & molecular morphologyMême sujetCancer Genomics and DiagnosticsTravaux en français237 207