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Enregistrement W2315310246 · doi:10.1139/w2012-013

Standardization and characterization of antigens for the diagnosis of aspergillosis

2012· article· en· W2315310246 sur OpenAlexvenueno aff
Cheila Denise Ottonelli Stopiglia, Alicia Arechavala, Mariana Carissimi, Júlia Medeiros Sorrentino, Valério Rodrigues Aquino, Tatiane Caroline Daboit, Luana Kammler, Ricardo Negroni, Maria Lúcia Scroferneker

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul
Mots-clésAntigenAspergillus fumigatusAspergillosisMicrobiologyAspergillus nigerAspergillusAspergillus flavusImmunodiffusionAspergillomaAllergic bronchopulmonary aspergillosisBiologyChemistryImmunologyAntibodyBiochemistryImmunoglobulin E

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study was to develop and characterize antigens for the diagnosis of aspergillosis. Nine strains of Aspergillus species Aspergillus fumigatus , Aspergillus flavus , and Aspergillus niger were grown in Sabouraud and Smith broth to produce exoantigens. The antigens were tested by immunodiffusion against sera from patients with aspergillosis and other systemic mycoses. The protein fraction of the antigens was detected by SDS-PAGE; Western blot and representative bands were assessed by mass spectrometry coupled to a nano Acquity UltraPerformance LC and analyzed by the Mascot search engine. Concurrently, all sera were tested with Platelia Aspergillus EIA. The most reactive antigens to sera from patients infected by A. fumigatus were produced by A. fumigatus MG2 Sabouraud and pooled A. fumigatus Sabouraud samples, both with a sensitivity of 93% and specificity of 100% and 97%, respectively. Aspergillus niger and A. flavus antigens were reactive against A. niger and A. flavus sera, each one with a sensitivity and specificity of 100%. Two proteins, probably responsible for antigenic activity, β-glucosidase in A. fumigatus and α-amylase in A. niger were attained. The commercial kit had a specificity of 22%, sensitivity of 100%, positive predictive value of 48%, and negative predictive value of 100%. The antigens produced showed high sensitivity and specificity and can be exploited for diagnostics of aspergilloma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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