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Enregistrement W2315354648 · doi:10.1021/ac301078n

Tailoring <sup>1</sup>H Spin Dynamics in Small Molecules via Supercooled Water: A Promising Approach for Metabolite Identification and Validation

2012· article· en· W2315354648 sur OpenAlexaff
Hashim Farooq, Ronald Soong, Denis Courtier‐Murias, Clemens Anklin, André J. Simpson

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistrySupercoolingMetaboliteIdentification (biology)MoleculeMolecular dynamicsDynamics (music)Chemical physicsSpin (aerodynamics)Computational chemistryThermodynamicsOrganic chemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolic mixtures are often analyzed via NMR spectroscopy as it provides a metabolic profile without sample alteration in a noninvasive manner. These mixtures however tend to be very complex and demonstrate considerable spectral overlap resulting in assignments that are sometimes ambiguous given the range of current NMR methods available. De novo molecular identification in these mixtures is generally accomplished using chemical shift information and J-coupling based experiments to determine spin connectivity information, but these techniques fall short when a molecule of interest contains nonrelaying centers. A method is presented here that enhances intramolecular spatial interactions via supercooled water and uses the resulting spatial correlations to edit mixtures. This is accomplished by utilizing nuclear Overhauser effect spectroscopy (NOESY) at subzero temperatures in capillaries to enhance NOE and provide more complete spin systems. This technique is applied to a standard mixture of three known molecules in D(2)O with overlapping resonances and is further demonstrated to assign molecules in a worm tissue extract. The current method proves to be a powerful complement to existing methods such as total correlation spectroscopy (TOCSY) to expand the range of molecules that can be assigned in situ without physical separation of mixtures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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