MiR-708-5p as a Predictive Marker of Colorectal Cancer Prognosis
Notice bibliographique
Résumé
Background: MicroRNAs (miRNA) are short non-coding RNA that act as negative regulators of gene expression. Altered levels of miR-708-5p have recently been described in many tumors, although its contribution in colorectal cancer (CRC) pathophysiology remains unclear. Methods/Patients: Quantitative real-time polymerase chain reaction was employed to evaluate the expression of miR-708-5p in 50 CRC and 20 paired adjacent noncancerous tissues. The relationship between miRNA levels and clinicopathological features was estimated using the Mann-Whitney test, and survival curves calculated by the Kaplan-Meier method. Additionally, in vitro assays were performed to investigate the possible role of miR-708-5p on CRC cell survival. Results: The expression level of miR-708-5p was significantly decreased in CRC tissues (3.79 fold-change, p=0.0112) when compared with non-neoplastic colon samples. Paired analysis in 20 CRC samples with their corresponding adjacent non-neoplastic tissue showed miR-708 downregulation in 60% of them. The same pattern was seen in DLD1 and HT-29 cell lines (~50-fold decrease). Interestingly, higher expression is observed in patients with poor prognosissuch as stage III/IV, relapse/metastasis and death, and shorter 5-year event free survival. Exogenous expression of miR-708 exerted a significant influence on clonogenicity in vitro. Conclusion: These results suggest that reduced miR-708-5p expression may contribute to the first stages of colorectal carcinogenesis. A shift in the regulation of miR-708-5p might operate in more severe stages of the disease. It seems that lower levels of miR-708 expression might connote less advanced disease and better prognosis. Further studies are needed to corroborate our results and better elucidate the role of miR-708 in CRC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».