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Enregistrement W2315676405 · doi:10.1158/1538-7445.am10-1865

Abstract 1865: <i>ERCC2</i> polymorphisms, smoking, and risk of breast cancer

2010· article· en· W2315676405 sur OpenAlexaffabout
Michael Conlon, Mary A. Bewick

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensNortheast Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésERCC2Breast cancerMedicineOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismOncologyPopulationNucleotide excision repairCancerInternal medicineDNA repairGeneticsGenotypeGynecologyBiologyEnvironmental healthGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The nucleotide excision repair (NER) pathway is important in the repair of bulky DNA lesions, including those that may be induced by cigarette smoking. Excision Repair Cross-Complementing Rodent Repair Deficiency, Complementation Group 2 (ERCC2) is an important gene in the NER pathway. Previous research suggests that polymorphisms in this gene may be associated with altered DNA repair capacity, cancer risk and treatment outcome. This study investigated whether two common single nucleotide polymorphisms (SNPs) in ERCC2 (ERCC2 Asp312Gln and ERCC2 Lys751Gln) were associated with risk of breast cancer, or modified a breast cancer risk associated with smoking. We used data previously collected from a primarily Caucasian population in northeastern Ontario Canada of 347 women diagnosed (2002-2004) with breast cancer and 775 population-based controls. The mailed study package contained a questionnaire that provided information on known breast cancer risk factors and lifetime residential and occupational history of exposure to passive and active smoking, and a buccal swab for genetic analyses. Odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (95% CI) were calculated using unconditional logistic regression, and used a refined referent group that excluded women with substantial exposure to passive smoke and who were never active smokers. Both SNPs were in Hardy-Weinburg Equilibrium (HWE) in controls. Overall, there was no significant association with either SNP and risk of breast cancer. Women who were active smokers of long duration (> 29 years), or high (>20) pack-years, were at significantly increased risk of breast cancer if they carried the G allele of ERCC2Asp312Gln, with ORs of 1.72 (95% CI 1.10-2.68) and 1.68 (95% CI 1.09-2.61) and p=0.03 and 0.007 for trend, respectively. Similar significantly increased risks were observed in women who carried the A allele of ERCC2 Lys751Gln, with ORs of 1.77 (95% CI 1.14-2.76) and 1.67 (95% CI 1.08-2.58) and p=0.02 and 0.01 for trend, respectively. In conclusion, our data suggest that polymorphisms in the NER pathway may modify a smoking-breast cancer relationship. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 1865.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,438

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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