Evaluation of the Ability of Short and Long Double-stranded RNAs to Induce Homologous Gene Silencing in the Protozoan Parasite, Toxoplasma gondii
Notice bibliographique
Résumé
Among recently developed genetic tools, RNA interference (RNAi) is one of the most effective methods used in eukaryotes.Although an RNAi-like mechanism can be invoked in Toxoplasma gondii, a highly effective RNAi methodology is still elusive.Using a dual luciferase system, the ability of short (28 nucleotides) and long dsRNA (~600 nucleotides) as RNA effectors controlling gene expression in T. gondii was evaluated.An effective down regulation can be observed when ≤ 1 microgram of short dsRNAs were used in the down regulation of Renilla luciferase.We have detected that short dsRNAs are better gene modulators than long dsRNA.Most importantly, due to its high sensitivity and reproducibility, the dual luciferase reporter system reported here offers an excellent tool to be used in (i) the standardization of the RNAi silencing methodology performed in different Toxoplasma laboratories, (ii) the detailed mechanistic study of the RNAi pathway, and (iii) the development of better genetic tools for the biological study of protozoan parasites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».