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Enregistrement W2315836353 · doi:10.1097/hjh.0b013e32834705e4

α-Kinase 2 is a novel candidate gene for inherited hypertension in Dahl rats

2011· article· en· W2315836353 sur OpenAlexafffund
Cristina Chauvet, Kimberley Crespo, Annie Ménard, Yanrui Wu, Chunjie Xiao, Marilyne Blain, Julie Roy, Alan Y. Deng

Notice bibliographique

RevueJournal of Hypertension · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGeneticsGeneCandidate geneCongenicLocus (genetics)AlleleQuantitative trait locusBiologySingle-nucleotide polymorphismGenetic linkageGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The interval harboring a quantitative trait locus for blood pressure (BP), C18QTL3, contains β-2 adrenergic receptor (Adrb2) and neural precursor cell expressed, developmentally downregulated 4-like (Nedd4l) genes. None of the other genes in the C18QTL3-residing interval is known to affect BP. The identification of C18QTL3 might uncover a brand new gene that could prosper into a novel diagnostic and/or therapeutic target for essential hypertension, if neither Adrb2 nor Nedd4l could be upheld as candidate genes. METHODS: Congenic fine resolution was combined with gene analyses. RESULTS: The gene encoding α-kinase 2 (Alpk2) contains a three base-pair deletion and multiple nonconserved mutations in its coding region in Dahl salt-sensitive (DSS) rats. In contrast, the gastrin-releasing peptide gene (Grp) possesses two nonconserved mutations, designated as single nucleotide polymorphisms 1 and 2 (i.e. SNP1 and SNP2), but could not be supported as a candidate gene because the C18S.L14 congenic strain displayed a homozygous DSS genotype at both SNP1 and SNP2. Furthermore, Adrb2 and Nedd4l could not account for the BP-diminishing effect of Lewis alleles in C18S.L14, as their DSS alleles bear functionally identical domains as those of Lewis, and no evidence of differential expression and splicing was evident. No significant nucleotide variations were found in 13 other genes closely linked to Alpk2. CONCLUSION: Alpk2 emerged as a strong candidate gene for C18QTL3. The present study is the first to implicate Alpk2 in the genetics of polygenic hypertension and paves the way for novel gene discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,803
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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