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Enregistrement W2315875453 · doi:10.1016/j.juro.2016.02.2820

PD08-04 VALIDATION OF A RISK CALCULATOR PREDICTING BIOPSY OUTCOME IN PROSTATE CANCER TREATED WITH ACTIVE SURVEILLANCE

2016· article· en· W2315875453 sur OpenAlexaboutno aff
Daan Nieboer, Monique J. Roobol, Ewout W. Steyerberg, Chris H. Bangma

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Urology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProstate cancerBiopsyCancerProstate biopsyCalculatorProstateGynecologyCancer detectionOncologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction and objectives: Prostate cancer patients on active surveillance (AS) are followed using repeat prostate biopsies (Bx), a burdensome intervention not without risks for patients. Most Bx, indicated by clinical indicators like PSA change and/or pre-defined time since diagnosis, do not show disease progression or risk reclassification. Identifying patients at low risk of progression or reclassification may reduce the number of these unnecessary Bx. Our objective was to validate the Canary-EDRN active surveillance biopsy risk calculator, which estimates the probability of upgrading or reclassification on biopsy (gleason grade≥7 or more than 34% of biopsy cores positive for cancer) using the patients age, months since last biopsy, last observed PSA level, percentage of cores positive for cancer on last biopsy and the number of prior negative biopsies.\nMethods: We used data from the Movember Global Action Plan (GAP-3) project, a global consortium of AS studies comprising of more than 10,000 PC patients. Patients were included from the prostate cancer research international: active surveillance (PRIAS), an American cohort (from Johns Hopkins), and a Canadian cohort (from Sunnybrook). These cohorts contained 5,129 follow-up biopsies in 3,412 PC patients. Calibration of the risk calculator was assessed graphically and the discriminative ability was quantified using the area under the receiver operating characteristic curve (AUC). Clinical usefulness was assessed using decision curves analysis (DCA).\nResults: The AUC at external validation was 0.64 in PRIAS, 0.73 in the American cohort and 0.66 in the Canadian cohort. The probability of upgrading or risk reclassification was somewhat over-estimated in PRIAS and the Canadian cohort and somewhat under-estimated in the American cohort. DCA showed that the model was clinical useful in each cohort for risk thresholds between 10% and 30%.\nConclusions: The risk calculator provided moderate discrimination in 3 cohorts of the GAP-3 consortium, but showed some miscalibration. Before applying the risk calculator in clinical practice recalibration may be required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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