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Enregistrement W2315884304 · doi:10.1021/ac201690t

Single-Cell-Kinetics Approach to Compare Multidrug Resistance-Associated Membrane Transport in Subpopulations of Cells

2011· letter· en· W2315884304 sur OpenAlexaff
Vasilij Koshkin, Sergey N. Krylov

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2011
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEffluxKineticsChemistryMultiple drug resistanceCellPopulationBiophysicsCell membraneStainingFluorescence microscopeCell biologyFluorescenceBiochemistryBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug resistance (MDR) driven by active efflux of drugs from the cells is one of the major obstacles in chemotherapies. Understanding the nature of MDR and designing more efficient chemotherapies requires the comparison of the efflux rate between different subpopulations of cells. Here we propose a single-cell-kinetics approach for such a comparison. In essence, the entire cell population is loaded with a suitable fluorescent substrate for MDR-associated membrane transporters. The kinetics of substrate efflux from individual cells is followed by time-lapse fluorescence microscopy and analyzed at the single-cell level. Microscopy is also used to assign cells to different subpopulations based on differences in morphology or level of staining by molecular probes. The kinetic parameters obtained for individual cells are then averaged for different cell subpopulations and the mean values of these parameters are finally compared between subpopulations. To test our single-cell-kinetics approach, we studied MDR-related efflux for two subpopulations of cultured breast cancer cells: cells in 2N and 4N phases of the cell cycle. The assignment of cells to 2N and 4N subpopulations was done by fluorescent DNA staining after the completion of efflux. By using the single-cell-kinetics approach, we were able to prove for the first time that the rates of MDR-related efflux differ in 2N and 4N phases of the cell cycle. We foresee that this approach will be an important tool in studies of MDR and in designing combination chemotherapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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