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Enregistrement W2315948620 · doi:10.1158/1538-7445.am10-4349

Abstract 4349: The chromosome 17q oncogene LASP1 promotes metastatic dissemination of medulloblastoma

2010· article· en· W2315948620 sur OpenAlexaff
Marc Remke, Christopher Traenka, Andrey Korshunov, Sebastian Bender, Hendrik Witt, Paul A. Northcott, Wolfram Scheurlen, Guido Reifenberger, Michael D. Taylor, Andreas E. Kulozik, Peter Lichter, Elke Butt, Stefan M. Pfister

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaIsochromosomeOncogeneBiologyCancer researchCancerMetastasisPrimary tumorOncologyPathologyInternal medicineMedicineChromosomeCell cycleGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma is the most common malignant brain tumor and one of the leading causes of cancer-related mortality in children. Treatment failure mainly occurs in children harboring tumors with microscopic or macroscopic metastases at the time of diagnosis, which typically show gain of 17q (often based on an isochromosome 17q), a common cytogenetic hallmark of intermediate and high-risk medulloblastoma. To pinpoint the oncogene(s) targeted by 17q gain, mRNA expression profiling was carried out in primary tumors with and without this indicative aberration and identified LIM and SH3 protein 1 (LASP1) as one of the most up-regulated genes on chromosome 17q in tumors with 17q gain. LASP1 (earlier named MLN50) was initially identified from a cDNA library of nodal breast cancer metastases and is highly expressed in more than 50% of metastatic human breast cancer, ovarian cancer, and hepatocellular carcinoma. In our study in medulloblastoma, a strong association of LASP1 mRNA abundance with 17q gain and metastatic disease at diagnosis was confirmed by quantitative real-time PCR in an independent cohort of 101 primary tumor samples. Protein expression was analyzed by immunohistochemistry in a large cohort of patients (n=207). High LASP1 protein expression was found to be strongly correlated with 17q gain, metastatic dissemination, and inferior overall and progression-free survival confirming our results on transcript level. Furthermore, multivariate analyses revealed LASP1 protein expression as an independent novel prognostic marker for overall survival and tumor progression in medulloblastoma. In vitro experiments in three established medulloblastoma cell lines demonstrate a strong reduction of cell migration and decreased proliferation upon LASP1 knockdown via siRNA, further indicating a functional role for LASP1 in the progression and metastatic dissemination of medulloblastoma. In conclusion, we have identified LASP1 as an important player in the metastatic dissemination of medulloblastoma which additionally has a high potential to serve as a molecular biomarker for outcome prediction in future prospective studies. Furthermore, LASP1 comprises a promising novel candidate molecule for future targeted therapy approaches in high-risk medulloblastoma. Note: This abstract was not presented at the AACR 101st Annual Meeting 2010 because the presenter was unable to attend. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 4349.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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