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Enregistrement W2316243903 · doi:10.3354/ame01720

Dissecting the role of viruses in marine nutrient cycling: bacterial uptake of D- and L-amino acids released by viral lysis

2014· article· en· W2316243903 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAquatic Microbial Ecology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDanmarks Frie Forskningsfond
Mots-clésNutrientLysisCyclingBiologyAmino acidNutrient cycleMicrobiologyChemistryBiochemistryEnvironmental chemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lysis of marine bacteria by viruses releases a range of organic compounds into the environment, including D-and L-amino acids, but the uptake of these compounds by other bacteria is not well characterized. This study determined that Photobacterium sp. strain SKA34 (Gammaproteobacteria) increased in abundance following uptake of D-and L-amino acids from viral lysate of Cellulophaga sp. strain MM#3 (Flavobacteria). Ammonium and dissolved free amino acids were taken up almost to detection limits, suggesting that the C:N ratio of bioavailable organic matter in the lysate was high for Photobacterium sp. growth, thus causing a net uptake of ammonium. In contrast, only 1.51 mol l -1 of the 4.77 mol l -1 of the total dissolved combined amino acids (DCAAs) were taken up, indicating that a fraction of lysate-derived DCAAs were semi-labile or refractory to bacterial uptake. Both D-and L-amino acid uptake rates were approximately proportional to their concentrations, indicating similar availability for each enantiomer and unsaturated uptake rates. These results imply that under high C:N conditions, both D-amino acids (mainly found in bacterial cell walls) and L-amino acids (found in proteins of the rest of the cell) are equally available for bacterial growth, and support arguments that viruses are key players in marine nitrogen cycling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle